哈茨木霉几丁质合酶基因ThChsC的克隆及序列分析
2011-09-01分类号：Q78
【部门】中国农业科学院植物保护研究所/农业部作物有害生物综合治理综合性重点实验室 中国农业科学院农业环境与可持续发展研究所
【摘要】【目的】克隆哈茨木霉几丁质合酶基因全序列,并对序列进行生物信息学分析。【方法】利用多聚酶链式反应(PCR)和染色体步移技术(genome walking)克隆几丁质合酶基因全序列;应用生物信息学软件对获得的基因序列及编码的蛋白序列进行分析;通过同源建模,对蛋白质的三维结构进行预测。【结果】从哈茨木霉(Trichoderma harzianum Th-33)中扩增得到几丁质合酶基因ThChsC(GenBank登录号HQ419000),编码区(CDS)长为2 835 bp,由4个外显子和3个内含子组成,开放阅读框(ORF)长2 688 bp,编码895个氨基酸。序列比对和同源性分析显示,该基因与串...
【关键词】哈茨木霉 几丁质合酶 基因克隆 序列分析
【基金】国家自然科学基金项目(30671400,31071728); 国家高技术研究发展计划(2011AA10A205); 中国农业科学院植物保护研究所基本科研业务费专项(1610142011002); 植物病害生物学国家重点实验室开放基金(SKL20100P17,SKL20110P13)
【所属期刊栏目】中国农业科学
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