磁珠富集法开发毛竹SSR标记引物
2011-12-15分类号:S795.7
【部门】国际竹藤网络中心 中国林业科学研究院林业研究所国家林业局林木培育重点实验室
【摘要】用磁珠富集法筛选毛竹基因组DNA的SSR分子标记,利用磁珠法对毛竹基因组DNA的AFLP片段进行了富集,分别构建了富含GT、AG、CCA重复基元的富集文库,利用克隆PCR法对文库进行筛选,检测菌落数分别为1080、620、630个,阳性菌落中含目的重复的序列分别为137、73、41个,富集效率分别为12.7%、11.8%、6.5%。双碱基重复的富集效率高于三碱基富集效率。根据获得的序列结果,设计了53对SSR引物,其中31对引物在毛竹中成功扩增出目的大小的条带,扩增成功率为58.9%。
【关键词】毛竹 磁珠富集法 文库筛选 SSR引物
【基金】林业公益性行业科研专项(No.200704001); 国家林业局重点项目(No.2007-01); “十一·五”科技支撑(2006BAD19B08)
【所属期刊栏目】林业科学研究
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