杨树抗黑斑病相关基因表达谱分析(英文)
2011-01-15分类号：S763.7
【部门】湖北省林业科学研究院 南京林业大学林木遗传和基因工程重点实验室
【摘要】利用黑斑病的高抗无性系美洲黑杨I-69及黑斑病的高感无性系欧美杨I-45为材料建立的2个cDNA文库,随机挑取cDNA克隆进行5’端EST序列测序,共获得有效序列20023条。序列经聚类分析和拼接后,共获得10816个Unigene,其中包括3734个Contig,7082个独立的Singleton。被注释的8853个具有同源性匹配序列基因中,按照GO的分子功能、生物过程和细胞组分3个不同分类角度进行分类。在具有功能注释的8853个Unigene中,选出330个与完成全基因组测序的毛果杨序列进行BLAST分析,结果发现有177个抗病相关候选基因出现在282个Unigene中,其中135个分布于...
【关键词】杨树 表达序列标签 抗病相关候选基因 表达谱
【基金】"948"Introduced Project (2006-4-80) from State Administration of Forestry
【所属期刊栏目】林业科学
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