基于牡丹EST信息的滇牡丹SSR标记开发
2011-04-15分类号：S685.11
【部门】中国林业科学研究院资源昆虫研究所国家林业局资源昆虫培育与利用重点实验室 中国林业科学研究院林业研究所
【摘要】对NCBI(美国国立生物技术信息中心)中牡丹的ESTs(expressed sequence tags)的序列进行分析,结果表明:在所分析的2 204条序列中,仅324条分布有SSRs(simple sequence repeats),占全部ESTs序列的14.70%;SSR的出现频率为15.20%,共计335个,其中,二核苷酸重复比例84.18%,三核苷酸重复比例为15.22%,四和六核苷酸重复比例为0.30%。在此基础上,利用软件(serafer 1.3)设计了51对备选SSR引物,以6个滇牡丹不同花色类群DNA为模板对引物进行筛选,其中,10对引物有扩增产物;用这些引物进一步在10个类群...
【关键词】牡丹 滇牡丹 EST SSR 标记
【基金】国家林业局948项目(2006-4-C07); 国家863计划(2006AA100109)
【所属期刊栏目】林业科学研究
文献传递
