草莓EST-SSR标记开发及在品种遗传多样性分析中的应用
2011-09-01分类号：S668.4
【部门】北京农学院植物科学技术学院 南京农业大学园艺学院/江苏省果树品种改良与种苗繁育工程中心 江苏省农业科学院园艺研究所
【摘要】【目的】探讨草莓EST序列中SSR位点的分布规律,开发草莓EST-SSR引物,并分析其在草莓品种遗传多样性研究中的应用。【方法】从NCBI公共数据库下载草莓表达序列标签(expressed sequence tag,EST)55 750条,利用MISA软件查找SSR位点,并利用Primer3.0 Plus软件设计60对引物,通过非变性聚丙烯酰胺凝胶(PAGE)研究这些SSR引物的PCR扩增特点,并对部分扩增产物进行克隆和测序,以验证其真实性。【结果】55 750条草莓EST序列含有SSR位点的序列1 334条,SSR位点1 490个。其中,二核苷酸、三核苷酸和六核苷酸重复是最主要的SSR类型,...
【关键词】草莓 EST SSR 遗传多样性
【基金】农业部保种专项项目(NB2010-2130135-7); 北京市教委科技发展计划项目(KM200710020012)
【所属期刊栏目】中国农业科学
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