烟草钾转运体基因TPK1的电子克隆及生物信息学分析
2011-01-08分类号:S572
【部门】四川农业大学农学院 植物生理学与生物化学国家重点实验室
【摘要】【目的】克隆烟草钾吸收转运基因,分析其亲缘关系,并预测其结构、性质与功能,为烟草钾转运体基因的功能研究提供基础。【方法】以利用RACE技术克隆出的烟草钾转运体基因片段的3'端序列为探针,对烟草EST数据库进行搜索,筛选与探针同源性在95%以上的EST序列,再利用DNAStar软件进行拼接。然后,应用多种生物信息学数据库和软件,对获得的烟草钾转运体基因全长cDNA序列进行结构、性质和功能预测。【结果】获得烟草钾转运体基因(TPK1)的cDNA全长。该基因所编码蛋白质的分子量为26.21 kD,理论等电点pI为9.72。该蛋白质是一个疏水膜蛋白,包含6个明显的跨膜螺旋拓扑结构,在二级结构中,共包含...
【关键词】烟草 钾转运体基因 生物信息学 Northern杂交
【基金】国家植物生理生化重点实验室开放课题(PPB08008)
【所属期刊栏目】中国农业科学
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