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大豆LEA基因家族全基因组鉴定、分类和表达

2011-10-01分类号:S565.1

【作者】李乐  许红亮  杨兴露  李雅轩  胡英考  
【部门】首都师范大学生命科学学院  
【摘要】【目的】鉴定大豆全基因组中的LEA家族基因,对其进行定位、分类以及组织表达分析,为植物LEA基因的功能研究与利用提供基础。【方法】利用大豆基因组数据库,通过生物信息学手段,鉴定并获得大豆LEA家族基因的全序列、定位和拷贝数信息;通过序列比对进行进化和分类分析;利用大豆发育表达芯片数据、NCBI中UniGene的EST表达数据进行组织表达谱分析。【结果】系统地分析鉴定了36个大豆的LEA家族基因,根据结构域的差异和系统发育分析将这些LEA基因分成8个亚家族。基因定位分析结果表明,这些基因分布于大豆的16条染色体上,启动子分析表明,几乎全部LEA基因的启动子区含有逆境反应顺式作用元件。各个发育阶段...
【关键词】LEA基因家族  全基因组鉴定  进化分析  差异表达基因
【基金】国家自然科学基金(30971783); 教育部留学回国人员科研启动基金
【所属期刊栏目】中国农业科学
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