棉花盐胁迫应答基因GhCPK5的克隆及序列分析
2011-06-15分类号:S562
【部门】中国农业大学农学与生物技术学院/农业部作物基因组学与遗传改良重点开放实验室/作物改良北京市重点实验室 湖北省农业科学院经济作物研究所
【摘要】本研究克隆了1个陆地棉新的钙依赖蛋白激酶基因GhCPK5(Genbank登录号为:HM002634)。GhCPK5基因组DNA序列全长3 031 bp,包含一个1 707 bp的开放阅读框,具有7个外显子和6个内含子。GhCPK5可能定位于细胞核内,有568个氨基酸残基,分子量为63 ku。氨基酸序列分析表明,陆地棉GhCPK5与杨树PtCPK5同源性达到89%,同样包含完整的激酶结构域和4个EF-hand结构域。RT-PCR分析表明,该基因在根、茎、叶等组织中表达;在盐胁迫处理下,GhCPK5在各组织的表达量明显上升。
【关键词】棉花 GhCPK5 盐胁迫应答 RACE 序列分析
【基金】国家“863”计划项目(2006AA10A108); 教育部新世纪优秀人才支持计划项目(NCET-06-0106)
【所属期刊栏目】中国农业大学学报
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