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陆地棉叶绿体基因组密码子使用偏性的分析

2011-01-16分类号:S562

【作者】尚明照  刘方  华金平  王坤波  
【部门】华中农业大学植物科学技术学院  中国农业科学院棉花研究所  中国农业大学农学与生物技术学院  
【摘要】【目的】通过分析陆地棉叶绿体基因组密码子使用偏性,探讨影响密码子偏性形成的主要因素。【方法】以陆地棉叶绿体基因组为研究对象,利用Mobyle及其它软件,分析叶绿体50个基因密码子的使用模式。【结果】陆地棉叶绿体基因组密码子GC1与GC2之间的相关系数达到极显著水平,GC3含量最低,与GC12的相关系数为0.14,双尾检验未达到显著水平;单个基因ENC比值多分布在-0.05—0.05;对应性分析,第一轴上显示了10.27%的差异,与GC3、ENC的相关系数分别为0.223和-0.147,均未达到显著水平。【结论】陆地棉叶绿体密码子第三位偏好使用嘧啶,而最优密码子多以A或T结尾;密码子使用模式可能...
【关键词】陆地棉  密码子偏性  GC含量  最优密码子
【基金】中央级公益性院所基本科研业务费(SJA0901); 国家“863”计划项目(2009AA101104); 国家自然科学基金(30170501)
【所属期刊栏目】中国农业科学
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