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南荻CCoAOMT基因的克隆与生物信息学分析

2011-10-15分类号:S561

【作者】洪艳云  黄志刚  易图永  
【部门】湖南农业大学生物科学技术学院  湖南农业大学生物安全技术学院  
【摘要】南荻是一种高木质纤维素含量的禾本科多年生草本植物,但其中的高木质素含量严重制约了它作为能源植物的开发利用。采用RT-PCR及RACE方法从南荻中分离到G木质素单体形成的关键酶CCoAOMT家族的一个基因,将该基因序列递交到GenBank,登录号为JF965572。该基因全长工1206bp,含有一个786bp的阅读框,编码一个261aa的蛋白,分子量约为29kD。通过NCBI在线比对发现该基因的预测蛋白与同为禾本科玉米的CCoAOMT酶蛋白有很高的同源性,最高达到94.0%;氨基酸序列多重比较的结果表明,该基因编码肽链含有CCoAOMT类基因全部的保守序列元件;系统进化树分析表明,该基因与玉米的...
【关键词】南荻  咖啡酰CoA-O-甲基转移酶  生物信息学分析  木质素
【基金】973前期项目资助项目(2010CB134403); 湖南农业大学校青年基金项目(07QN30)
【所属期刊栏目】中南林业科技大学学报
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