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鲤胰蛋白酶原基因的电子克隆及生物信息学分析

2010-11-15分类号:S917.4

【作者】陈文波  李卫国  赵亚军  
【部门】河南理工大学资源环境学院生物系  
【摘要】为深入研究胰蛋白酶在鱼类中的生理功能和作用机制,利用生物信息学的方法,成功获得了鲤3种胰凝乳蛋白酶原cDNA序列(ccTRP1、ccTRP2和ccTRP3)并对其进行了序列分析。结果表明,三者均含有一个长度为729bp的开放阅读框(open reading frame,ORF),编码由242个氨基酸组成的胰蛋白酶原,其中包括15个氨基酸组成的信号肽和5个氨基酸(LDDDK)组成的激活肽。总平均亲水性GRAVY(grand average of hydropathicity)分析表明,三者均是亲水性蛋白。氨基酸比对结果显示,三者具备胰蛋白酶原的保守结构特征,如含有催化三联体氨基酸(His-57、...
【关键词】鲤  胰蛋白酶原  表达序列标签  生物信息学
【基金】河南理工大学博士基金项目资助(B20107)
【所属期刊栏目】水产学报
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