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桑种质资源ITS序列与系统进化分析

2010-05-08分类号:S888

【作者】陈仁芳  余茂德  刘秀群  陈龙清  
【部门】华中农业大学园艺林学学院/园艺植物生物学教育部重点实验室  西南大学生物技术学院/农业部蚕桑学重点开放实验室  
【摘要】目的分析桑ITS序列,为桑系统位置、进化关系、DNA指纹鉴别、育种亲本选择提供分子生物学依据。方法利用收集的73份桑资源,总DNA提取,PCR扩增,测序,并从GenBank下载桑科Moraceae,桑属MorusITS序列,软件分析ITS长度、变异位点、G+C含量、遗传分歧、同源性百分比差异、系统位置与进化关系。结果获得ITS完整序列,基本序列全长576bp,G+C含量59.55%。(ITS1:174bp,G+C含量61.49%,ITS2:302bp,G+C含量62.25%,5.8S:100bp,G+C含量48.00%)。序列比对表明,共166个变异位点,(ITS1:100,ITS2:66,5...
【关键词】桑  ITS  指纹鉴别  进化关系
【基金】教育部西南大学博士访学基金项目(XN-00701)
【所属期刊栏目】中国农业科学
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