宏基因组学方法分析奶牛瘤胃尿素分解菌的多样性
2010-02-15分类号：S852.6
【部门】中国农业科学院北京畜牧兽医研究所/动物营养学国家重点实验室 甘肃农业大学动物科学技术学院
【摘要】利用脲酶保守序列ureC引物和细菌16S rDNA通用引物PCR扩增并测序,揭示奶牛瘤胃尿素分解菌的多样性。提取本研究室前期鉴定的16个脲酶克隆的质粒,利用脲酶保守序列ureC引物和细菌16S rDNA通用引物进行PCR扩增,将PCR产物连接到pMD19-T载体,转化E.coliJM109,挑取阳性克隆测序。利用Blast程序将序列与GenBank和RDP数据库进行比对,并使用Mega 4.0软件构建系统发育树。4个脲酶克隆含有脲酶保守序列ureC,系统发育树分析表明,U1、U5、U13和U15分别属于Firmicutes、ε-Proteobacteria、β-Proteobacteria和A...
【关键词】脲酶 尿素分解菌 多样性 宏基因组学 16S rDNA ureC
【基金】北京市自然科学基金资助项目(6092017); 动物营养学国家重点实验室自主研究课题(2004DA125184(团)0801)
【所属期刊栏目】中国农业大学学报
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