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猪TDRP1基因的电子克隆及生物信息学分析

2010-12-15分类号:S828

【作者】张伟  方梅霞  聂庆华  张细权  
【部门】华南农业大学动物科学学院  广东省农业动物基因组学与分子育种重点实验室  暨南大学医学院  
【摘要】利用生物信息学和比较基因组学方法,对猪TDRP1基因的结构、表达及功能进行分析,结果表明:(1)电子克隆获得猪TDRP1基因cDNA部分序列共776bp,包括119bp的5′UTR、561bp的编码区和96bp的3′UTR,共编码合成187个氨基酸多肽;(2)猪TDRP1基因CDS序列与人、小鼠和大鼠的同源性分别为85%、76.1%、77.1%.编码合成的猪TDRP1蛋白与人、小鼠、大鼠之间的同源性分别为82.5%、71.1%和70.1%;(3)猪TDRP1蛋白的相对分子质量为20489.8,不含信号肽,为1个可溶性蛋白,同时也是1个非分泌性蛋白,存在4个二级结构区段;(4)基于cDNA及ES...
【关键词】猪  TDRP1基因  电子克隆  生物信息学
【基金】农业部转基因生物新品种培育重大专项(2008ZX08006-005;2009ZX08009-145B); 粤港关键领域重点突破项目(2008A02)
【所属期刊栏目】湖南农业大学学报(自然科学版)
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