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猪Musclin基因编码蛋白的生物信息学分析

2010-01-10分类号:S828

【作者】孙超  王力  齐仁立  姜东凤  
【部门】西北农林科技大学动物科技学院  
【摘要】【目的】克隆猪Musclin基因,分析和预测其编码蛋白的结构与功能。【方法】从猪肌肉组织中提取总RNA,RT-PCR扩增获得Musclin基因,对其进行克隆和测序,并根据生物信息学分析方法,利用Tmpred、SignalP3.0、TargetP 1.1等分析软件,对猪Musclin蛋白的跨膜结构、信号肽、细胞定位、结构特征等进行分析和预测。【结果】猪Musclin蛋白主要集中在分泌途径上,存在于细胞外,其核苷酸序列与家兔的具有较高的相似性,氨基酸序列32~45位和55~63位存在2个可能的强跨膜螺旋区,该蛋白的空间结构以α螺旋、β转角和无规则卷曲为主;其1~26位氨基酸序列是一段信号肽,在26...
【关键词】Musclin  生物信息学  结构与功能  序列分析
【基金】国家自然科学基金项目(30871785); 教育部重点项目(105167); 教育部新世纪优秀人才计划项目(NCET-06-0865); 国家“十一五”科技支撑计划项目(2006BAD04A11)
【所属期刊栏目】西北农林科技大学学报(自然科学版)
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