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梨EST-SSR标记的开发及其在梨品种遗传多样性分析中的应用评价

2010-12-23分类号:S661.2

【作者】王西成  姜淑苓  上官凌飞  曹玉芬  乔玉山  章镇  房经贵  
【部门】南京农业大学园艺学院  农业部果树种质资源利用重点开放实验室  中国农业科学院果树研究所  
【摘要】【目的】分析梨EST中SSR位点分布规律,开发梨EST-SSR引物,探讨EST-SSR用于梨品种遗传差异研究的可行性。【方法】从NCBI公共数据库中下载梨表达序列标签(expressed sequence tag,EST)1293条,利用MISA软件对其进行SSR位点查找,将符合条件的序列选出,利用Primer3.0Plus软件设计48对引物,通过非变性聚丙烯酰胺凝胶(PAGE)研究这些SSR引物的PCR扩增特点,并对部分扩增产物克隆与测序,以验证其真实性。【结果】1293条梨的EST序列中含有SSR位点的序列为82条,SSR位点92个。二核苷酸、三核苷酸和六核苷酸重复是最主要的SSR类型,分...
【关键词】梨  EST  SSR  遗传多样性
【基金】国家科技支撑项目(2008BAD92B07)
【所属期刊栏目】中国农业科学
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