苹果Ty1-copia类逆转座子LTR_(10)序列及其在苹果属植物中的遗传多样性分析
2010-01-30分类号：S661.1
【部门】南京农业大学园艺学院 安徽农业大学园艺学院 安徽省农业科学院园艺研究所 中国农业科学院果树研究所
【摘要】应用改良的Pearce方法分离苹果Ty1-copia类逆转座子RNaseH-LTRs,分离到的RNaseH-LTR_(10)序列已在GenBank注册(登录号DQ534515),该序列长度为299 bp。分析结果表明其5′端为含有终止密码子的RNaseH基因,PPT(polypurinetract)之后是3′-LTR,PPT起始于终止密码子内10 bp处,3′-LTR的起始标志末端倒转重复序列(inverted repeat,IR)TG紧随其后。LTR_(10)的正链和反链均含有多个启动子的特征结构TATA box和CAAT box,α-淀粉酶启动子的保守序列及受不同胁迫条件作用的调控元件,如...
【关键词】苹果 Ty1-copia类逆转座子LTRs 调控元件 遗传多样性
【基金】国家自然科学基金项目(30200190,30740034); 安徽农业大学稳定与引进人才科研启动专项基金项目(wd2006-8)
【所属期刊栏目】南京农业大学学报
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