番茄斑萎病毒属病毒SRNA序列比对
2010-04-15分类号:S436.412
【部门】云南农业大学农学与生物技术学院 云南农业大学烟草学院
【摘要】从生物信息数据库NCBI中搜索并下载最新有关番茄萎斑病毒属Tospovirus各种间SRNA片段全长序列以及该片段上NSs、N的核酸和蛋白质序列着手,运用DNAstar和DNAMAN以及NPSA等生物信息软件对其进行比对分析,结果发现,以NSs蛋白序列建立的系统进化树显示CCSV和TZSV之间的同源性为85.8%,IYSV和TYRV之间的同源性达90%,MYSV和PSMV间的同源性为97.5%;通过N蛋白序列分析显示,Tospovirus属中有7组同源性较高的种;在Tospovirus属病毒中非极性氨基酸含量最高,极性酸性氨基酸最少,比较TSWV中抗性破坏RB株系与普通株系在NSs、N核酸、蛋...
【关键词】番茄斑萎病毒属 核壳体序列 SRNA上的非结构蛋白序列 抗性破坏
【基金】国家“973”计划项目(2006CB100204); 云南省自然科学基金项目(2005C0036M,2007C0036M); 云南省教育厅项目(5Y0171B)
【所属期刊栏目】湖南农业大学学报(自然科学版)
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