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基于元分析与结构域注释的大豆胞囊线虫抗性基因挖掘

2010-12-08分类号:S435.651

【作者】常玮  韩英鹏  胡海波  李文滨  
【部门】东北农业大学大豆研究所/教育部大豆生物学重点实验室  
【摘要】【目的】挖掘大豆胞囊线虫(Heterodera glycines Ichinohe,SCN)抗性基因,并分析其在不同大豆品种中及同一品种的不同组织中的表达情况,探讨其在抗SCN反应中的作用。【方法】采用图谱整合软件BioMercator2.1将不同来源的QTL整合到遗传图谱GmComposite2003上,并通过元分析的方法获得一致性QTL。运用抗病基因注释的方法获得一致性QTL内包含的抗性候选基因,同时采用分子生物学手段克隆预测得到的基因,并采用半定量RT-PCR的方法进行表达分析。【结果】通过元分析获得了27个一致性位点,根据hmmsearch的搜索结果显示,共得到77个SCN抗性候选基因...
【关键词】大豆  大豆胞囊线虫  抗病基因  表达分析
【基金】国家“863”计划项目(2006AA100104-4); 国家“973”计划项目(2009CB118400); 黑龙江省教育厅面上项目(11541025); 哈尔滨市科技创新人才研究专项(2009RFQXN085)
【所属期刊栏目】中国农业科学
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