虾夷扇贝外套膜和肾脏组织cDNA文库构建以及EST的初步分析
2010-05-15分类号：S917.4
【部门】辽宁省海洋水产科学研究院 辽宁省海洋水产分子生物学重点实验室 辽宁师范大学生命科学学院
【摘要】利用SMARTcDNA文库构建试剂盒首次构建了健康虾夷扇贝(Mizuhopecten yessoensis)外套膜和肾脏2种组织的cDNA文库。2个文库容量分别为2.30×106CFU/mL和1.20×106CFU/mL,重组率均超过98%,平均插入片段长度均大于1kb,文库质量符合标准要求。将随机选取的4009个克隆进行5′端测序,得到3884个有效序列(外套膜923个,肾脏2961个),测序成功率96.9%。经过质量控制和拼接,共得到2007条单基因簇(Unigenes),包含363个序列重叠群(Contigs)和1644条单一序列(Singletons)。通过BLASTx和BLASTn搜...
【关键词】虾夷扇贝 cDNA文库 免疫相关基因 EST-SSR
【基金】国家海洋公益性行业科技专项项目(200805037); 辽宁省科学技术计划重大;重点项目(2008203001); 辽宁省海洋与渔业科研计划项目(200801)
【所属期刊栏目】中国水产科学
文献传递
