刺参消化道内含物细菌群落组成的PCR-DGGE分析
2010-07-15分类号：S917.4
【部门】中国水产科学研究院黄海水产研究所 中国科学院海洋研究所
【摘要】利用PCR-DGGE技术研究刺参(Apostichopus japonicus)前肠、中肠和后肠内含物的细菌群落组成。通过软件Bio-rad Quantity one分析DGGE指纹图谱,发现刺参后肠内含物的条带数目显著高于前肠和中肠(P=0.003,P=0.016),表明刺参后肠内含物的细菌多样性最高,其次是中肠;前肠内含物的细菌多样性最低。UPGMA聚类分析发现,不同刺参个体其后肠的细菌群落组成差异最小,前肠的细菌群落差异最大。经DGGE分离、条带切割和序列测定,共获得了13条序列,系统发育分析表明,刺参消化道内含物的细菌群落可主要归属于5大类群,即α-变形菌纲(α-proteobacte...
【关键词】刺参 PCR-DGGE 消化道内含物 细菌群落
【基金】国家自然科学基金资助项目(40906071); 中国博士后科学基金资助项目(20090451355); 中国水产科学研究院黄海水产研究所基本科研业务经费资助项目(2009-ts-07)
【所属期刊栏目】中国水产科学
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