缘管浒苔rbcL全长cDNA克隆与序列分析
2010-05-15分类号：S917.3
【部门】上海海洋大学农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室 中国水产科学研究院东海水产研究所 中国水产科学研究院盐碱地渔业工程技术中心 Department of Marine Sciences University of Connecticut
【摘要】对缘管浒苔光合作用第一关键酶Rubisco大亚基基因(rbcL)全长cDNA序列进行了克隆分离。首先应用RT-PCR方法获得了rbcL大片段cDNA序列,序列长度为1101bp,并进行了测序分析。然后分别应用5′RACE方法和3′RACE方法获得2个克隆序列,其序列长度分别为371bp和579bp,并进行了测序分析。在此基础上,将3个片段序列进行拼接,获得了Rubisco大亚基全长cDNA序列(1472bp),其中包括1425bp的编码区序列及47bp的前导序列(NCBI登录号:DQ813496),并推断出蛋白质序列(474个氨基酸)。对序列进行了相关生物信息分析和同源性比对,结果显示与已克隆...
【关键词】缘管浒苔 核酮糖1 5-二磷酸羧化酶/加氧酶大亚基基因(rbcL基因) 前导序列 cDNA未端快速扩增 cDNA
【基金】国家海洋局绿潮灾害专项课题; 国家自然科学基金项目(30371101); 教育部博士点基金项目; 上海市科委优秀学科带头人计划项目(08XD14037); 上海市水生生物学重点学科资助项目(S30701)
【所属期刊栏目】水产学报
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