小麦EST-SSR标记的开发和遗传作图
2010-03-15分类号:S512.1
【部门】山东农业大学农学院/作物生物学国家重点实验室
【摘要】【目的】利用小麦EST序列数据库开发EST-SSR标记。【方法】对GenBank/dbEST注册的普通小麦EST序列(2006.4.18—2007.2.4)进行SSR查找,采用Primer5.0软件设计EST-SSR引物,选用3个小麦品种进行有效性检测,利用RIL群体和Mapmaker/Exp3.0软件进行遗传作图。【结果】在265362条普通小麦EST序列中,共发现6314个SSR,占整个EST数据库的2.38%。其中二核苷酸、三核苷酸重复序列最多,分别为2237(35.43%)和2084(33.01%)个。二核苷酸重复中,以GA/CT和AG/TC出现频率最高、分别占SSR总数的17.85%...
【关键词】小麦 EST-SSR 分子标记 RIL 遗传图谱
【基金】国家自然科学基金(3057155)
【所属期刊栏目】中国农业科学
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