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苏云金芽孢杆菌杀虫晶体蛋白基因cry1A的克隆及生物信息学分析

2010-04-28分类号:S476.1

【作者】赵直  吴钢  王闵霞  朱旭东  蒲志刚  张志勇  彭正松  蔡平钟  
【部门】西华师范大学  四川省农业科学院生物技术核技术研究所  中国水稻研究所  四川省蚕业管理总站  
【摘要】以分离的3株苏云金芽孢杆菌质粒为模板,通过设计一对特异引物,PCR扩增得到3条全长3.6 kb的基因序列,其各自都包含一个完整的开放阅读框,编码序列全长分别是3468、3450、2697 bp(Genebank登录号分别为GQ385073,GQ385074,GQ385075);它们与cry1A类基因同源性都高达95%以上;分别编码1159、1150和902个氨基酸。并在此基础上采用生物信息学方法对这3个基因编码蛋白从氨基酸组成、理化性质、跨膜结构域、疏水性/亲水性、亚细胞定位、跨膜结构域以及功能域等方面进行了预测和分析。为转基因抗虫植物和微生物杀虫工程菌的构建提供了基因来源。
【关键词】cry1A基因  苏云金芽孢杆菌  克隆  生物信息学
【基金】四川省农业科学院重点研究项目“主要农作物优质抗逆基因克隆与利用研究”
【所属期刊栏目】西南农业学报
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