晚疫病诱导的番茄叶片cDNA文库构建及序列分析
2010-10-15分类号:S436.412
【部门】云南农业大学园林园艺学院
【摘要】以番茄抗病品系(CLN2037E)为研究材料,应用SMART技术构建晚疫病诱导的番茄叶片cDNA表达文库,并进行生物信息学分析。成功构建的cDNA文库的克隆数为2.3×109,重组率为96%,通过PCR检测,插入片段范围在0.1~2.0 kb之间。从文库中随机挑取110个克隆进行测序,最终得到107条差异表达ESTs序列。GenBank提交的序列号为GT742146-GT742150;GT865998-GT866099。利用BLAST进行同源性分析:75条ESTs与其他物种同源性较高,视为已知基因,功能涉及能量代谢的占42.7%、细胞内生命活动与信号传导的占10.7%、基因转录和翻译的占9.3...
【关键词】番茄 晚疫病 cDNA文库 EST序列分析
【基金】云南省科技攻关计划(2006NG17)
【所属期刊栏目】中国农业大学学报
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