麻疯树磷酸烯酮式丙酮酸羧化酶pepc基因全长cDNA克隆及序列分析
2010-06-15分类号：Q943.2;S794.9
【部门】中国林业科学研究院亚热带林业研究所 中国林业科学研究院林业研究所
【摘要】应用RT-PCR和RACE法从麻疯树总RNA中分离出pepc基因全长cDNA,长度为3 142 bp,阅读框2 898 bp,编码965个氨基酸,在GenBank中登录,序列号为EU069413。它的氨基酸序列与蓖麻、陆地棉、橙、大豆、花生、烟草、油菜、拟南芥的氨基酸同源性分别为94.94%、92.46%、90.60%、90.50%、90.50%、88.33%、84.61%、82.44%。该基因编码了pepc基因家族中的pepc1,蛋白属于C3型PEPC。推测了pepc编码蛋白分子量为110.6 kD,并对其稳定性、二级结构、疏水性等特性进行了分析,最后确定了该蛋白的功能位点和结构域。
【关键词】麻疯树 pepc基因 克隆
【基金】浙江省重大科技专项重点项目(2005C12003;2006C12030)
【所属期刊栏目】林业科学研究
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