植物CBF1转录因子的生物信息学分析
2010-06-15分类号:Q943
【部门】四川农业大学林学院
【摘要】利用生物信息学手段,对GenBank中18种不同植物CBF1的氨基酸序列进行比对及系统发育树的构建,并对其氨基酸的组成、等电点、亲水/疏水性、蛋白质的二级结构和三级结构及功能域进行分析预测。结果表明:18种不同植物CBF1的N端存在富含精氨酸和赖氨酸残基的核定位信号(NLS)、与DNA结合的AP2核心结构域以及C端的酸性氨基酸。构建CBF1进化树,并对其分子进化进行探讨。CBF1的氨基酸主要是脂肪族类,都含有非极性氨基酸Ala,其蛋白等电点多数为酸性,且为不稳定亲水性蛋白。α-螺旋和无规则卷曲是18种不同植物CBF1最大量的结构元件,而β-转角和延伸链则散布于整个蛋白质中。不同植物CBF1蛋白...
【关键词】CBF1 生物信息学 分子进化
【基金】国家科技支撑计划项目(2008BADC2B02); 四川省“十一五”重点攻关项目(2006YZGG-10-07)
【所属期刊栏目】林业科学
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