类猪圆环病毒因子P1 VP2蛋白二级结构与B细胞表位预测
2009-10-28分类号：S852.65
【部门】江苏省农业科学院兽医研究所农业部动物疫病诊断与免疫重点开放实验室国家兽用生物制品工程技术研究中心 中国农业大学动物医学院农业部预防兽医学重点开放实验室 河北省动物卫生监督所
【摘要】旨为预测类猪圆环病毒因子P1 VP2蛋白的B细胞表位。采用生物信息软件和互联网服务器,预测VP2的二级结构,分析VP2表面特性(亲水性、可塑性、可及性和抗原性),综合预测VP2的B细胞抗原表位。结果表明,P1VP2蛋白肽链的6-18和80-92区段为预测的B细胞表位优势区。多参数方案综合预测P1 VP2蛋白的B细胞抗原表位,为进一步鉴定表位及设计疫苗奠定了基础。
【关键词】P1 二级结构 B细胞表位 生物信息学 预测
【基金】国家“973”计划前期研究专项(2007CB116308); 江苏省自然科学基金(BK2008351)
【所属期刊栏目】华北农学报
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