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中华绒螯蟹部分基因组文库构建和微卫星位点的筛选

2009-03-15分类号:S917.4

【作者】毛瑞鑫  鲁翠云  刘福军  赵莹莹  谷晶晶  常玉梅  梁利群  孙效文  
【部门】中国水产科学院黑龙江水产研究所  上海海洋大学水产与生命学院  大连水产学院生命科学与技术学院  
【摘要】利用磁珠富集和放射性杂交相结合构建了中华绒螯蟹基因组微卫星文库。并利用生物素标记的(GA)12探针进行微卫星片段的富集。将得到的片段与pGEM-T载体连接后转入DH5α大肠杆菌中,然后利用γ-32P同位素标记的(GA)12探针进行第二次筛选。结果共获得微卫星基因组文库1 500个菌,杂交前菌落PCR检测阳性克隆率为62.5(;杂交后得到的阳性克隆为447个,占29.8(。经测序,有248个克隆含有重复次数大于5次的微卫星序列。在得到的微卫星序列中,重复单元除GA/CT外,还观察到三碱基、四碱基重复单元。根据侧翼序列设计引物164对,选择合成50对,通过优化PCR反应条件,结果有21对引物可扩增...
【关键词】中华绒螯蟹  微卫星  磁珠富集
【基金】国家科技基础条件平台建设(2005DKA30470-005)
【所属期刊栏目】上海海洋大学学报
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