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5.8S rDNA-ITS区片段的序列分析在坛紫菜种质鉴定中的应用

2009-11-15分类号:S917.3

【作者】赵玲敏  谢潮添  陈昌生  纪德华  
【部门】集美大学水产学院  
【摘要】为探讨DNA序列标记技术在坛紫菜种质鉴定中的应用,对10个野生坛紫菜种质材料的5.8S rDNA-ITS区进行PCR扩增和序列分析,结果发现扩增的片段长度在1208~1219bp之间,可以分为ITS1区,5.8S区和ITS2区3个部分,其中5.8S区片段的长度完全一致,均为160bp;ITS1区和ITS2区片段的长度也非常接近,只有几个碱基的差异。多重序列比对发现10个种质材料的ITS区(包括ITS1和ITS2)序列都存在一定差异,序列同源性在95.82%~99.73%之间,而5.8S区序列则完全一致,但与其它种紫菜的5.8S区序列有很大差异,序列同源性在79.7%~95.0%之间。由此认为5...
【关键词】坛紫菜  5.8S rDNA  转录单元内间隔区  序列分析
【基金】国家自然科学基金(40676077,40806065); 国家“八六三”高技术研究发展计划(2006AA10A413); 福建省科技平台建设项目(2007N2011); 福建省自然科学基金(2007J0064)
【所属期刊栏目】水产学报
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