鳜肌肉组织cDNA文库构建及其ESTs分析
2009-08-15分类号:S917
【部门】广西师范大学生命科学学院 长沙大学生物工程与环境科学系 中国科学院基因组研究所
【摘要】以鳜(Siniperca chutasi)肌肉为实验材料,采用非均一化引物定向克隆技术构建了鳜肌肉组织cDNA文库,并进行大规模EST测序和序列分析。结果显示,cDNA文库的库容量为2.3×105,重组率达96.5%,平均插入片段长度为1.2 kb。随机挑选5456个克隆,成功测序5191个,其中高质量序列5063个,达97.5%。利用PHRAP程序聚类拼接后,得到1625条非冗余序列,包括443个重叠群(Contigs),1182个单拷贝(Singlets)。使用BLAST软件将这些序列同GenBank等数据库进行比对、注释,发现1625个非冗余序列与鳜肌肉结构和发生相关,而其中991条序列...
【关键词】鳜(Siniperca chutasi) 肌肉 cDNA文库 EST
【基金】国家自然科学基金面上项目(30771644); 湖南省自然科学基金项目(09JJ6037,08JJ064)
【所属期刊栏目】淡水渔业
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