柞蚕核型多角体病毒p11基因克隆及序列分析
2009-04-28分类号:S885.1
【部门】沈阳农业大学生物科学技术学院 西南大学农业部蚕桑学重点开放实验室
【摘要】为丰富柞蚕核型多角体病毒分子生物学基础,通过PCR扩增克隆了ApNPVp11基因并进行了序列的生物信息学分析。ApNPVp11基因编码102个氨基酸,预测分子量11.2 kDa;氨基酸序列N端1~33位是信号肽序列,中部50~72位是跨膜区。PSI-BLAST搜索表明有20种核型多角体病毒编码蛋白与ApNPV P11蛋白有显著性匹配;比对分析发现P11蛋白氨基酸序列中部相对保守,两端变异较大。进化分析表明ApNPV属于NPV类群I且与EppoNPV、AgMNPV、CfDefNPV亲缘关系较近。
【关键词】杆状病毒 p11基因 序列分析
【基金】沈阳农业大学中青年研究生导师基金资助(2006); 国家自然科学基金资助(30800803;30771630)
【所属期刊栏目】华北农学报
文献传递