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慈竹4CL基因的克隆及其生物信息学分析

2009-08-10分类号:S795.504

【作者】胡尚连  曹颖  黄胜雄  孙霞  卢学琴  蒋瑶  
【部门】西南科技大学生命科学与工程学院  
【摘要】【目的】克隆慈竹木质素生物合成酶4CL基因,研究其序列特征,为今后利用该基因调控慈竹木质素的生物合成研究奠定基础。【方法】参照其他物种4CL基因保守区,设计简并引物,以慈竹幼笋cDNA为模板,克隆到1条750 bp的4CL基因保守区片段。以这条保守区片段为模板,结合5′RACE和3′RACE克隆4CL基因全长序列,并对其进行了生物信息学分析。【结果】成功克隆了慈竹4CL基因全序列,该序列CDS区全长为1 674 bp,编码558个氨基酸;氨基酸序列中存在两大4CL氨基酸保守域(SSGTTGMPKGV和GEICIRG),其中前一个氨基酸保守域的第7个氨基酸位点变为M,与常见的L不同,表明慈竹的4...
【关键词】慈竹  4CL基因  克隆  生物信息学分析
【基金】四川省应用基础研究基金资助项目(05JY029-101); 四川省教育厅项目(2003031022); 四川省青年基金资助项目(041100); 西南科技大学重点项目(2006031030)
【所属期刊栏目】西北农林科技大学学报(自然科学版)
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