基于EST序列的杨树候选SNPs标记分析
2009-12-15分类号:S792.11
【部门】湖北省林业科学研究院 南京林业大学林木遗传和基因工程实验室
【摘要】利用生物信息学方法对来自2个不同cDNA文库的2万余条杨树EST序列进行了候选SNPs标记。研究结果表明,在获得的94个碱基替代型候选SNPs中,A/G替换类型最多,占32.98%,C/T替换型占13.83%,其它碱基置换型SNPs占53.20%。同时,对其中20个候选SNPs位点的重新测序结果表明,有13个(占65%)候选SNPs位点得到证实,其中,11个位点为碱基替代型SNPs,另外2个为杂合型位点。
【关键词】单核苷酸多态性 表达序列标签 杨树
【基金】国家林业局“948”项目(2006-4-80)资助
【所属期刊栏目】华中农业大学学报
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