青花菜BoPGIP1基因的分子克隆及其生物信息学分析
2009-08-28分类号:S635
【部门】青岛农业大学生命科学学院
【摘要】根据GenBank已发表的PGIP基因序列设计引物,通过PCR直接扩增的方法从青花菜(Brassica oleraceavar.italicaP)中克隆了一个新的PGIP基因,命名为BoPGIP1。BoPGIP1基因序列全长为1102 bp,由2个外显子和1个内含子构成,外显子总长为993 bp,编码330个氨基酸序列,分子量为37 kDa。对推导的氨基酸序列进行分析,发现该序列包含5个N-糖基化位点,2个蛋白激酶C磷酸化位点,5个酪蛋白激酶II磷酸化位点,4个N-豆蔻酰化位点。将BoPGIP1氨基酸序列与数据库中的其他植物PGIP进行同源序列比对,构建系统进化树,发现所比对基因都含有LRR结...
【关键词】BoPGIP1 克隆 序列分析 生物信息学
【基金】青岛农业大学校高层次人才启动基金(630745)
【所属期刊栏目】华北农学报
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