适用于竹林土壤PCR-DGGE分析用的微生物总DNA提取及纯化方法
2009-04-15分类号:S714
【部门】浙江林学院浙江省现代森林培育技术重点实验室
【摘要】为了获得完整、高纯度的竹林土壤微生物总DNA,采用改良的十二烷基硫酸钠-高盐抽提法对5种竹林土壤进行DNA提取,通过DNA凝胶回收试剂盒纯化粗提的DNA,利用细菌16 S rDNA基因的V3区引物对纯化的DNA进行了聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)验证。结果表明,该方法所需土壤样品少,抽提的DNA片段均在23kb以上,完整性好;采用DNA凝胶回收试剂盒纯化能够有效去除粗提DNA中大部分杂质,获得高质量的DNA;以此DNA为模板进行DGGE检测所反映的微生物信息量丰富。
【关键词】微生物学 竹林土壤 微生物 DNA提取 聚合酶链反应-变性梯度胶电泳
【基金】浙江省自然科学基金资助项目(Y307469); 浙江省现代森林培育技术重点实验室开放基金资助项目(200605)
【所属期刊栏目】浙江林学院学报
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