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茶苗嫩根cDNA文库的构建和EST分析

2009-01-30分类号:S571.1

【作者】史成颖  宛晓春  江昌俊  张正竹  
【部门】安徽农业大学农业部茶叶生物化学和生物技术重点开放实验室  
【摘要】以茶苗嫩根为材料,采用SMART技术构建了cDNA文库并对其质量进行了鉴定。结果显示,该文库的重组率为92%,库容量为5×105,平均插入片段长度超过1 kb,是一个较高质量的文库。从文库中随机挑取克隆并从5′端单向测定2 651个克隆,获得2 600个有效的EST(expressed sequence tag),序列的平均长度为703 bp,用Phrap软件进行拼接,结果获得404个contigs、610个singlets。通过与NCBI的非冗余核酸数据库进行Blastx比对,初步确定已知功能基因734个,推定功能基因102个,未知功能基因178个。该结果既为进一步分离克隆茶树根部功能基因奠...
【关键词】cDNA文库  嫩根  茶树  表达序列标签  测序
【基金】国家重大基础研究前期研究专项(2004CCA06400); 国家自然科学基金项目(30571194)
【所属期刊栏目】南京农业大学学报
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