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梨火疫病病原菌(Erwinia amylovora)三型分泌系统的鉴别及Erwinia spp. HrpA的分析

2009-02-10分类号:S436.612

【作者】朱勃  金谷雷  怀雁  谢关林  
【部门】浙江大学生物技术研究所  浙江大学生物信息学研究所  
【摘要】【目的】明确梨火疫病病原菌(Erwinia amylovora)三型分泌系统(type Ⅲ secretion system,TTSS)的所在区域、相关基因及Erwinia spp.的HrpA(hypersensitive response and pathogenicity gene A)选择压水平。【方法】利用生物信息学方法,通过BLAST程序对梨火疫病菌基因组的核苷酸数据库进行同源比对,同时对Erwinia spp.与宿主互作的表面蛋白HrpA进行选择压分析。【结果】TTSS分析结果显示在40kb大小的毒力岛上有27个TTSS相关基因。通过与看家基因及毒力岛上的致病性相关的重要基因Hrp...
【关键词】梨火疫病  三型分泌系统  HrpA  正向选择  净化选择
【基金】国家高技术研究与发展计划(2006AA10A211); 国家自然科学基金(30871655,30671397); 杭州市农业发展基金(2007-2)
【所属期刊栏目】中国农业科学
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