标题
  • 标题
  • 作者
  • 关键词

大豆疫霉基因组SSR标记开发

2009-09-10分类号:S435.651

【作者】徐静静  王晓鸣  段灿星  武小菲  朱振东  
【部门】中国农业科学院作物科学研究所/国家农作物基因资源与基因改良重大科学工程  
【摘要】【目的】开发大豆疫霉基因组SSR标记,为从分子水平深入研究大豆疫霉及其近缘种提供一种理想的分子标记。【方法】用FPCR软件从大豆疫霉全基因组序列中查询SSRs,选择合适的SSR序列用Primer5.0软件设计引物。【结果】从发现的1234个含有2~4个碱基重复单元的完全SSRs中选出260段设计引物,经10个大豆疫霉分离物基因组DNA检测,有213对(81.9%)扩增出SSR特征条带,其中114(53.5%)对引物扩增出多态性。通用性检测表明,14.6%~28.6%引物分别在选择的8个疫霉种中有效扩增。基于10个SSR标记数据进行聚类分析,结果表明表明这些标记可以完全区分大豆疫霉及其它疫霉。【...
【关键词】大豆疫霉  全基因组序列  SSR标记  通用性
【基金】国家“十一五”科技支撑计划(2006BAD08A08,2006BAD08A15); 公益性行业(农业)科研专项(3-20); 国家重点基础研究发展计划“973”项目(2002CB111406)
【所属期刊栏目】中国农业科学
文献传递