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应用GDPs转录物标记法进行水稻白叶枯病菌早期侵染表达谱分析

2009-10-10分类号:S435.111

【作者】张新建  高世强  吴茂森  何晨阳  
【部门】中国农业科学院植物保护研究所/植物病虫害生物学国家重点实验室  
【摘要】【目的】揭示水稻白叶枯病菌(Xanthomonas oryzae pv.oryzae,Xoo)在侵染水稻叶组织早期的基因表达谱差异。【方法】采用GDPs-Finder计算法,设计了能够覆盖KACC10331基因组全部ORFs的定向引物(GDPs),对Xoo与水稻互作1、3和7d的总RNA进行反转录,对病菌cDNA探针进行Cy3/Cy5选择性标记,与含有371个Xoo致病相关基因的芯片进行杂交。【结果】在水稻侵染的不同时期,Xoo致病相关基因表达谱存在差异。与在NBY中生长相比,Xoo在侵染1、3和7d时分别有42个(18个上调和23个下调)、51个(29个上调和22个下调)和33个(16个上调...
【关键词】水稻白叶枯病菌  GDPs  侵染早期  表达谱  差异表达基因
【基金】国家自然科学基金项目(30671353); 国家农业行业科研专项经费项目(nyhyzx07-056); 国家重点实验室自主研究课题专项(SKL2009SR03)
【所属期刊栏目】中国农业科学
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