东乡野生稻RPS2类候选抗病基因的克隆与分析
2009-04-15分类号：S511.903.4
【部门】中南大学研究生院隆平分院 湖南西城杂交水稻基因科技有限公司 国家杂交水稻工程技术研究中心
【摘要】利用NBS保守结构域获得的探针及基于RecA文库富集方法的试剂盒筛选东乡野生稻液体pCAMBIA1301质粒文库,杂交筛选获得阳性克隆,在NCBI上进行BLASTN序列比对后,设计相关引物,扩增获得编码区,并利用生物信息学方法预测其编码蛋白序列,与已克隆的NBS-LRR类抗性基因建立进化树.结果分析表明,其预测蛋白除了部分氨基酸缺失及2个氨基酸不同外,与粳稻大部分序列一致,分子进化树表明其与粳稻、拟南芥RPS2基因的关系最近.
【关键词】东乡野生稻 液体质粒文库 长片段高保真PCR 生物信息学
【基金】国家“973”项目(2007CB109007); 国家“863”重点项目(2006AA100101); 国家科技支撑计划项目(2007BAD77B00)
【所属期刊栏目】湖南农业大学学报(自然科学版)
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