水稻β-淀粉酶基因密码子使用特性分析
2009-10-15分类号：S511
【部门】中国农业大学农业部作物基因组学与遗传改良重点实验室/北京市作物遗传改良重点实验室 国际水稻研究所植物育种 遗传学与生物技术系 国际水稻研究所植物育种遗传学与生物技术系 悉尼大学生物科学学院
【摘要】本研究分析了水稻10个β-淀粉酶基因(OsBmy1～OsBmy10)在cDNA和蛋白质上的同源性,分析了每个基因反映密码子使用特性的参数——GC含量、同义密码子第1～3位置中的GC含量、有效密码子数和相对同义密码子使用度。结果表明:水稻β-淀粉酶家族基因序列间的同源性差异较大,在cDNA和蛋白质序列上的基因同源性分别为39.2～79.6和25.9～74.0,其中,OsBmy3和OsBmy9间的同源性最高;OsBmy3、OsBmy4、OsBmy5、OsBmy7、OsBmy9和OsBmy10等为高GC含量基因,并表现出极强的密码子使用偏好。可见,水稻β-淀粉酶基因在进化过程中不仅氨基酸组成发生了分...
【关键词】水稻 β-淀粉酶 密码子使用偏好 进化 GC含量
【基金】2003 Themel budget of the Challenge Program for Waterand Food; 长江学者与创新团队计划; 高等学校学科创新引智计划(111-2-03)
【所属期刊栏目】中国农业大学学报
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