拟南芥次生生长相关NAC转录因子保守结构域分析
2009-05-10分类号:Q943
【部门】西南科技大学生命科学与工程学院
【摘要】【目的】了解植物次生生长调控网络以及挖掘新型次生生长相关NAC转录因子。【方法】通过生物信息学手段对19个拟南芥次生生长相关NAC转录因子进行氨基酸序列比对及系统发生树的构建,寻找保守结构域,并对其保守结构域及蛋白质的二级结构、亚细胞定位等进行分析、预测。【结果】通过对19个拟南芥NAC转录因子的N端保守域进行划分,共发现A、B、C、D、E5个保守性不同、同时含有多个化学修饰位点以及疏水性区域的亚结构域,其中亚域D可能涉及DNA绑定及核定位信号功能,而位于多变氨基酸序列C端的F区与G区,可能涉及转录激活功能,而该区域也是划分次生生长相关NAC转录因子亚家族的重要区域。【结论】拟南芥NAC类转录...
【关键词】拟南芥 次生生长 NAC转录因子 生物信息
【基金】四川省教育厅自筹项目(06ZD1018); 西南科技大学博士基金项目(06ZX7126)
【所属期刊栏目】西北农林科技大学学报(自然科学版)
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