米氏凯伦藻18S rDNA和转录间隔区序列分析
2009-11-15分类号：Q943
【部门】中国水产科学研究院东海水产研究所农业部海洋与河口渔业资源及生态重点开放实验室 上海海洋大学水产与生命学院
【摘要】对赤潮多发藻米氏凯伦藻(Karenia mikimotoi)核糖体18S rDNA及其转录间隔(ITS)区序列PCR扩增并测序,获得18S rDNA和ITS基因序列长度分别为1 690 bp和654 bp。结合12种甲藻和1种硅藻作序列比较分析,分别在ITS1、ITS2序列寻找到适宜设计特异性引物探针区域,并用邻接法构建系统进化树,研究各藻种间亲缘关系。遗传距离分析结果显示米氏凯伦藻与短凯伦藻(Karena brevis)、微小卡罗藻(Karlodinium micrum)等分类学上较近的藻种18S rDNA序列相似度为97%~99%,远大于微小原甲藻(Prorocentrum minimum...
【关键词】米氏凯伦藻 核糖体18S rDNA 转录间隔区 系统进化 分子鉴定
【基金】上海市科学技术委员会科研计划项目(062358101); 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金(中国水产科学研究院东海水产研究所)资助项目(2007M22)
【所属期刊栏目】上海海洋大学学报
文献传递
