小菜粉蝶颗粒体病毒lef-3基因的克隆与分析
2009-12-10分类号:S476.1
【部门】苏州大学医学部
【摘要】【目的】研究杆状病毒lef-3基因的起源与进化,从分子水平明确病毒之间的亲缘关系。【方法】通过常规PCR方法获得小菜粉蝶颗粒体病毒晚期基因表达调控因子lef-3的基因片段,克隆后测序,然后利用软件对lef-3及编码序列进行生物信息学分析。【结果】克隆得到的PiraGVlef-3基因ORF序列中存在4个突变位点,但氨基酸性质未发生改变,推导PiraGV LEF-3蛋白含399个氨基酸残基,分子量为3.99kD;通过高级结构预测及其编码序列与其它杆状病毒的LEF-3同源性比对表明,该基因可能编码单链DNA结合蛋白;BLAST比对发现lef-3基因只存在于鳞翅目昆虫为宿主的杆状病毒基因组;进化分析表...
【关键词】小菜粉蝶颗粒体病毒 晚期基因表达调控因子LEF-3 单链DNA结合蛋白 进化起源
【基金】国家“863”高技术研究发展计划(2006AA10A118)
【所属期刊栏目】中国农业科学
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