【摘要】2008年2月,教育部出台了《独立学院设置与管理办法》,为解决独立学院发展过程中出现的重要问题提供了指导和依据,希望以此进一步加强独立学院建设,促进独立学院健康发展。但是,《办法》颁布近一年以来,具体执行起来颇有难度。究其原因,主要是一些关键问题并不在《办法》的规范之列。本文试就独立学院办学过程中最受争议也最为关键的关于独立学院性质、公益性与营利性、独立办学等问题,剖析《办法》相关条款与实际情况存在的矛盾,提出了解决问题的思路。