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银鲳皮肤和肌肉组织的基因表达谱分析

2008-07-15分类号:S917.4

【作者】杨琳琳  蒋燕  杨桂梅  许柳雄  陈新军  徐善良  鲍宝龙  
【部门】上海海洋大学农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室  上海海洋大学海洋科学学院  宁波大学生命学院海洋生物工程重点实验室  
【摘要】采用目前国际上最为通用的cDNA文库构建方法,构建了银鲳皮肤和肌肉组织的cDNA文库,通过一定规模的序列测定,并借助生物信息学技术,分析了164个序列,得到了105个不同的基因(或表达序列标签),在105个不同的基因中,68.6%基因没有冗余,1倍、2倍、3倍和4倍冗余的分别占23.8%,3.8%,2.8%和1%。皮肤和肌肉组织表达基因的组成中,除了21个没有同源序列的未知基因外,可初步归为代谢相关的酶(38个)、DNA有关的酶(7个)、结构蛋白(4个)、膜蛋白(13个)、线粒体蛋白(1个)、转录因子(9个)、信号传导相关的蛋白(10个)和未知蛋白(2个)等8大类,其中,转录因子、膜蛋白,和D...
【关键词】银鲳  基因表达谱  皮肤  肌肉  表达序列标签
【基金】上海海洋生物资源与环境创新平台项目(6870305); 上海市教委重点学科项目(Y1101); 上海市教委重点项目(06ZZ65)
【所属期刊栏目】上海水产大学学报
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