异育银鲫Toll样受体3的cDNA序列分析与蛋白质高级结构预测
2008-03-15分类号：S917.4
【部门】上海水产大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点开放实验室 上海水产大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点开放实验室 上海水产大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点开放实验室 上海水产大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点开放实验室 上海水产大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点开放实验室 上海200090 上海200090 上海200090 上海200090 上海200090
【摘要】利用RT-PCR、RACE及克隆等方法获得了异育银鲫Toll样受体3(cagTLR3)基因全长cDNA序列。该cDNA全长3170bp,5′端非编码区181bp;3′端非编码区283bp;开放阅读框(ORF)2706bp,编码901个氨基酸。经序列同源性分析显示,其编码的氨基酸序列与金鱼、斑马鱼、斑点叉尾、虹鳟和红鳍东方有较高的相似性,其相似性分别为92%、88%、79%、75%和72%,说明TLR3在长期的进化中具有较高保守性。TLR3全长序列起始21个氨基酸残基为信号肽;50至695个氨基酸残基间包含15个富含亮氨酸的重复序列(LRR);704至726个氨基酸残基为跨膜区(TM);75...
【关键词】异育银鲫 Toll样受体3 cDNA末端快速扩增 序列分析 蛋白结构预测 生物信息学
【基金】上海市科委重点科技攻关计划(073205111); 上海市重点学科建设项目(Y1101)
【所属期刊栏目】水产学报
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