三疣梭子蟹基因组小卫星特征分析
2008-11-15分类号:S917.4
【部门】中国水产科学研究院黄海水产研究所 中国海洋大学海洋生命学院
【摘要】通过构建三疣梭子蟹部分基因组文库,对获得的4164个克隆测序,共获得总长度为622409bp的DNA序列。在序列拼接后长度500~1500bp的709个克隆中,筛选到130个小卫星序列,其序列总长度占测序序列总长度的2.55%。小卫星序列中,以12bp重复单位的序列数量最多(10.77%),总体趋势表现为重复单位越长,相应的重复序列数目越少(R=-0.663,P<0.01)。小卫星重复单位拷贝数分布范围以8bp重复单位最广为3.9~66.5;其次是13bp重复范围在2.0~40.6;再次是26bp重复,范围在2.3~21.0。平均拷贝数最高的三种重复类型分别为8bp重复(19.96),25bp...
【关键词】三疣梭子蟹 基因组 重复序列 小卫星
【基金】国家“八六三”高技术研究发展计划项目(2006AA10A406); 国家自然科学基金(30871933); 青岛市科技计划项目(07-2-3-5-jch)
【所属期刊栏目】水产学报
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