三疣梭子蟹基因组微卫星特征分析
2008-09-15分类号：S917.4
【部门】中国水产科学研究院黄海水产研究所 中国海洋大学海洋生命学院
【摘要】对三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)部分基因组DNA文库测序,获得了总长度为622409个碱基的基因组DNA序列,从中找到微卫星重复序列(1~6bp重复)697个。统计微卫星重复类型,以两碱基重复数目最多,为445个,占微卫星序列总数目的63.84%;其次是三碱基重复152个,占21.81%;再次分别是单碱基重复45个,占6.46%;四碱基重复31个,占4.45%;五碱基重复14个,占2.01%;六碱基重复10个,占1.43%。在单碱基重复类型中,重复拷贝类别全部为A;两碱基重复类型中,AG重复数目最多,其次是AC和AT;三碱基重复类型中以ACT最多,其次是AGG和...
【关键词】三疣梭子蟹 基因组 微卫星
【基金】国家高技术研究发展计划(863计划)项目(2006AA10A406); 国家科技基础条件平台项目(2006DKA30470); 青岛市科技计划项目(07-2-3-5-jch).
【所属期刊栏目】中国水产科学
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